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KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库是系统分析基因产物在细胞中的代谢途径以及这些基因产物功能的数据库。KEGG该数据库有助于把基因及表达信息作为一个整体的网络进行研究。KEGG整合了基因组、化学分子和生化系统等方面的数据,包括代谢通路(PATHWAY)、疾病(DISEASE)、基因序列(GENES)及基因组(GENOME)等。 1. 所有鉴定蛋白KEGG Mapping结果统计
2. 所有鉴定蛋白KEGG结果注释统计
3. KEGG通路注释统计 在生物体内,不同的基因产物相互协调来行使生物学功能,对差异表达基因的通路(Pathway)注释分析有助于进一步解读基因的功能。
4. KEGG通路分类 对差异表达基因KEGG的注释结果按照KEGG中通路类型进行分类
5. KEGG通路富集分析 分析差异表达蛋白在某一通路上是否过出现(over-presentation)即为差异表达蛋白的通路富集分析。我们采用Kobas软件进行差异表达蛋白的KEGG通路富集分析。
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