质谱分析仪器供应信息
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百泰派克公司基于高分辨率质谱仪Obitrap Fusion Lumos,结合丰富的生物信息学分析经验,建立了全新一代蛋白从头测序和突变分析(De Novo Sequencing)平台,实现对蛋白一级结构快速准确的分析。
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STRING是收录多个物种预测的和实验验证的蛋白质-蛋白质互作的数据库,包括直接的物理互作和间接的功能相关。结合差异表达分析结果和数据库收录的互作关系对,构建差异表达蛋白互作网络。分析过程中将差异表达蛋白映射到STRING数据库中,获得差异蛋白的相互作用关系信息。
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为检验所选取的差异表达蛋白质或特征差异表达蛋白质的合理性和准确性,可以通过聚类分析将蛋白按照表达量的趋势聚合在一起,可以实现更为直观的蛋白质组学数据分析。
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KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库是系统分析基因产物在细胞中的代谢途径以及这些基因产物功能的数据库。KEGG该数据库有助于把基因及表达信息作为一个整体的网络进行研究。KEGG整合了基因组、化学分子和生化系统等方面的数据,包括代谢通路(PATHWAY)、疾病(DISEASE)、基因序列(GENES)及基因组(GENOME)等。
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百泰派克采用topGO对差异表达蛋白进行富集分析,可以得到差异表达蛋白在GO节点中的富集显著性。并对显著富集的节点在GO体系中的层级关系以有向无环图的形式进行直观展示。
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